Nat. Catal | 人工酶中两个非生物催化位点同时作用的协同催化反应

本周为大家介绍一篇2020年发表在Nature Catalysis的文章:人工酶中两个非生物催化位点同时作用的…

ACS Catal. | 机器学习引导的酶定向进化文库设计:训练集组成对序列空间探索的影响

2021年11月,东京大学Koji Tsuda团队和日本东北大学Mitsuo Umetsu团队共同在ACS C…

ACS Catal. | 深度序列−功能表征揭示增强酶活性的多种途径

2022年2月,塔夫茨大学化学与生物工程系的NikhilU. Nair教授团队在ACS Catalysis上发…

Cell Reports Methods|非天然氨基酸控制哺乳动物细胞逻辑门的发展

逻辑门是指一个输入控制一个期望输出的集成系统。在哺乳动物细胞中使用逻辑门是复杂的可逆细胞控制的一个快速发展的领…

虚位以待

Angewandte. |通过减少酶表面的不利盐桥增加有机溶剂耐受性

德国亚琛大学报告了一种智能盐桥设计策略,同时提高模型酶枯草杆菌脂肪酶A(Bacillus subti…

JBC | 温度对聚合酶保真性的影响

2021年7月,斯坦福大学的Stephen R. Quake《生物化学杂志》(JOURNAL OF BIOLO…

利用PQQ依赖型脱氢酶实现一锅双酶生物催化胺化外消旋仲烯丙醇

2020年11月,格拉茨大学化学研究所Wolfgang Kroutil团队在ChemCatChem上发表了题为…

利用分隔式自我复制(CSR)改造来自于Thermus thermophilus的I型DNA聚合酶

在基因元件(例如DNA聚合酶)的定向进化中,CSR(分隔式自我复制)和CPR(分隔式同伴复制)是一类重要的方法…

Nat. Commun. | 用于遗传密码扩展的吡咯赖氨酰-tRNA合成酶/tRNA对和经典合成酶/tRNA对的嵌合设计

文章链接:https://www.nature.com/articles/s41467-020-16898-y…

ACS Catal. | 基于GRAPE策略的计算设计实现温和条件下塑料生物降解

2021年1月,中国科学院微生物研究所的吴边团队在ACS Catalysis上发表文章提出了一种新型蛋白质稳定…

Nuture | 一种具有非标准有机催化机制的酶的设计和进化

2019年6月,曼彻斯特大学生物技术研究所Anthony P. Green团队在Nuture上发表了题为“De…

利用非天然氨基酸起始蛋白的翻译

今天给大家介绍一个合成生物学中比较有意思的研究–利用非天然氨基酸起始蛋白的翻译。 2019年12月…

双功能脱氢酶通过形成高阶螺旋体结构来调节底物通道从而调节其酶活性

双功能脱氢酶通过形成高阶螺旋体结构来调节底物通道从而调节其酶活性 2020年波尔多大学的Rémi Fronze…

浙江大学于浩然课题组BA综述|让定向进化更容易的“热点”

近日,浙江大学化学工程与生物工程学院于浩然研究团队与伦敦大学学院Paul A. Dalby教授课题组合作撰写的…

高阶螺旋体结构对双功能乙醛-乙醇脱氢酶活性影响

2019年,韩国高等科技学院的Ji-Joon Song团队在Nature communication上发表了关…

从二氧化碳到淀粉的无细胞化学酶法合成

2021年9月24日,中科院天津工业生物技术研究所与中科院大连化学物理研究所等团队在Science 上联合发表…

氨酰-tRNA合成酶的持续定向进化

2017年11月16日,David Liu(刘如谦)研究团队在Nature Chemical Biology …

单加氧酶不对称合成(R)-兰索拉唑和其他亚砜类药物

DOI: 10.1007/s00253-021-11230-0 Applied Microbiology an…

ACS Catalysis:具备多底物特异性和对映立体选择性的新型麻黄碱脱氢酶的鉴定及研究

DOI: 10.1021/acscatal.9b00621 Tarek Shanati,Cameron Loc…

Chemistry—A European Journal | 镧系离子如何影响甲醇脱氢酶的加成-消除步骤

大家好,今天分享一篇2020年发表在Chemistry—A European Journal的文章——How …

Cell Chemical Biology:通过光响应性非天然氨基酸来光控酶的变构

大家好,今天分享一篇2019年发表在Cell Chemical Biology的文章,题目是“Light Re…

初学Gromacs

初学Gromacs

 GROMACS是一套分子动力学模拟程序包,主要用来模拟研究蛋白质、脂质、核酸等生物分子的性质,在模…

制造业的未来取决于生物技术

作者:John Cumbers,SynBioBeta的创始人及CEO。SynBioBeta是合成生物学领域的学…

新型冠状病毒检测技术

新型冠状病毒的特征 在具体介绍检测方法之前,有必要介绍下病毒本身。新型冠状病毒,世界卫生组织(WHO)最近将其…

基于体外合成生物学的糖类药物高效合成与创新

摘要: 蛋白质,DNA和糖分子并称为生命三大物质,糖类及含糖分子在药物领域有着重要的地位。但是目前制约糖类药物…

Design and use of de novo cascades for new benzylisoquinoline biosynthesis

摘要: 苄基异喹啉生物碱是一类具有化学结构多样性的化合物,存在于开花植物的次级代谢产物中。目前已知的苄基异喹啉…

trRosetta: 在台式机上从头折叠一个蛋白——这台台式机最好有一块好显卡

作者: 刘源 北京大学化学与分子工程学院-王初题组特聘博士后 一、前言 去年CASP上AlphaFold打败了…

再创丨越快越好?先到先得?进化的游戏可不是这么玩的

作者:孟凡康 预计阅读时间:15min ”物极必反,否极泰来”。简单来说,任何事情不一定是越极端越好。这对于小…

再创丨利用二氧化碳作为唯一碳源的自养型大肠杆菌诞生

在生命进化的历史长河中,从第一个生命诞生开始到第一个可以利用二氧化碳的自养型生命出现一共经历了多久的时间?答案…

QM方法在计算生物酶反应机理中的应用

【摘要】 主要介绍QM方法在计算生物酶反应机理中的应用,其中包括该方法下,一个常用软件模块Jaguar软件包的…

开发理性设计方法用于酶分子改造

【摘要】 定向进化和理性设计是两种常见的酶分子改造策略。定向进化策略已经被成功应用于酶活性、稳定性、底物特异性…

通过计算机设计来降低抗体片段构象的灵活性及聚合速率

嘉宾:章程博士,伦敦大学学院 主持人:惠成功 时间:2019年9月3日晚20:00 摘要: Computati…

一文详细了解双特异性抗体

目前癌症免疫治疗的有力工具包含单克隆抗体、肿瘤疫苗、免疫检查点抑制剂、CAR-T细胞免疫疗法以及双特异性抗体(…

号外 | 王初课题组与陈鹏课题组合作开发通用活体蛋白激活技术

近日,本课题组与北京大学化学与分子工程学院陈鹏课题组合作,在Nature杂志上发表题为“Time-resolv…

基于遗传密码子扩展技术研究蛋白-蛋白相互作用

蛋白-蛋白相互作用在生命活动中扮演十分重要的角色,研究蛋白-蛋白相互作用将有助于阐明特定生命过程及为相关疾病的…

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