标签：分子动力学模拟

Angewandte. |通过减少酶表面的不利盐桥增加有机溶剂耐受性

德国亚琛大学报告了一种智能盐桥设计策略，同时提高模型酶枯草杆菌脂肪酶A（Bacillus subti…

生物催化剂 • 2022-05-23 511赞 5阅读 25评论

GROMACS蛋白配体模拟：配体使用amber GAFF力场

软件与材料本文内容使用到如下软件： Ambertools 20 GROMACS 2019.5 Gaussia…

生物信息技术 • 2020-08-20 954赞 4阅读 26评论

GROMACS蛋白配体分子动力学模拟预处理过程简要笔记

体系说明本文主要针对蛋白配体模拟体系的预处理过程做一个简短的记录。体系中包含一个蛋白质，六个初始位置不同的配…

生物信息技术 • 2020-08-20 969赞 2阅读 29评论

GROMACS蛋白配体分子动力学模拟结果分析简要笔记

0. 引言本文以前文为基础，对蛋白配体复合物分子模拟体系的结果进行一系列的粗浅分析，本文记述了简要的分析方法…

生物信息技术 • 2020-08-20 1.10K赞 4阅读 26评论