Nature | 机器学习辅助改造PET水解酶

2022年4月,德克萨斯大学奥斯汀分校Andrew D. Ellington团队和Hal S. Alper团队…

《Frontiers in Microbiology》大肠杆菌C321.△A的转录组和蛋白质组的比较分析

将非典型氨基酸(ncAAs)引入到蛋白质中已被证明是调控蛋白质结构和功能以及研究许多生物学过程的有效手段。提高…

Nat.Commun. | 嵌合体翻译系统的定向进化,可用于高效的整合非天然氨基酸以及营养缺陷型菌体的构建

2021年12月,浙江大学林世贤团队在Nature Communications发表题为“Directed-e…

Nat. Catal | 人工酶中两个非生物催化位点同时作用的协同催化反应

本周为大家介绍一篇2020年发表在Nature Catalysis的文章:人工酶中两个非生物催化位点同时作用的…

虚位以待

ACS Catal. | 机器学习引导的酶定向进化文库设计:训练集组成对序列空间探索的影响

2021年11月,东京大学Koji Tsuda团队和日本东北大学Mitsuo Umetsu团队共同在ACS C…

文献管理神器—Zotero 介绍

最近,我发现组内的师兄师姐在保存文献的时候还是在用文件夹的方式,对文献重命名方式也是各种样式,不方便查找。于是…

ACS Catal. | 深度序列−功能表征揭示增强酶活性的多种途径

2022年2月,塔夫茨大学化学与生物工程系的NikhilU. Nair教授团队在ACS Catalysis上发…

Cell Reports Methods|非天然氨基酸控制哺乳动物细胞逻辑门的发展

逻辑门是指一个输入控制一个期望输出的集成系统。在哺乳动物细胞中使用逻辑门是复杂的可逆细胞控制的一个快速发展的领…

Angewandte. |通过减少酶表面的不利盐桥增加有机溶剂耐受性

德国亚琛大学报告了一种智能盐桥设计策略,同时提高模型酶枯草杆菌脂肪酶A(Bacillus subti…

JBC | 温度对聚合酶保真性的影响

2021年7月,斯坦福大学的Stephen R. Quake《生物化学杂志》(JOURNAL OF BIOLO…

利用PQQ依赖型脱氢酶实现一锅双酶生物催化胺化外消旋仲烯丙醇

2020年11月,格拉茨大学化学研究所Wolfgang Kroutil团队在ChemCatChem上发表了题为…

利用分隔式自我复制(CSR)改造来自于Thermus thermophilus的I型DNA聚合酶

在基因元件(例如DNA聚合酶)的定向进化中,CSR(分隔式自我复制)和CPR(分隔式同伴复制)是一类重要的方法…

Nat. Commun. | 用于遗传密码扩展的吡咯赖氨酰-tRNA合成酶/tRNA对和经典合成酶/tRNA对的嵌合设计

文章链接:https://www.nature.com/articles/s41467-020-16898-y…

ACS Catal. | 基于GRAPE策略的计算设计实现温和条件下塑料生物降解

2021年1月,中国科学院微生物研究所的吴边团队在ACS Catalysis上发表文章提出了一种新型蛋白质稳定…

Nuture | 一种具有非标准有机催化机制的酶的设计和进化

2019年6月,曼彻斯特大学生物技术研究所Anthony P. Green团队在Nuture上发表了题为“De…

利用非天然氨基酸起始蛋白的翻译

今天给大家介绍一个合成生物学中比较有意思的研究–利用非天然氨基酸起始蛋白的翻译。 2019年12月…

双功能脱氢酶通过形成高阶螺旋体结构来调节底物通道从而调节其酶活性

双功能脱氢酶通过形成高阶螺旋体结构来调节底物通道从而调节其酶活性 2020年波尔多大学的Rémi Fronze…

浙江大学于浩然课题组BA综述|让定向进化更容易的“热点”

近日,浙江大学化学工程与生物工程学院于浩然研究团队与伦敦大学学院Paul A. Dalby教授课题组合作撰写的…

高阶螺旋体结构对双功能乙醛-乙醇脱氢酶活性影响

2019年,韩国高等科技学院的Ji-Joon Song团队在Nature communication上发表了关…

LeDock 应用于药物虚拟筛选

目前,一种药物被批准上市平均需花费20-30亿美元和10多年的开发。基于结构的虚拟筛选有可能加速药物研发。通过…

从二氧化碳到淀粉的无细胞化学酶法合成

2021年9月24日,中科院天津工业生物技术研究所与中科院大连化学物理研究所等团队在Science 上联合发表…

PROTOCOL网站

合理有效的protocol是保证研究正常推进的重要手段,对于某一专业领域的研究人员来讲,长期研究总结的经验可能…

氨酰-tRNA合成酶的持续定向进化

2017年11月16日,David Liu(刘如谦)研究团队在Nature Chemical Biology …

Bio3D的安装与应用实例(DCCM)

1. Bio3D的介绍 Bio3D 是一款依托于 R 语言的工具包,包含用于分析生物分子结构、序列和轨迹数据的…

单加氧酶不对称合成(R)-兰索拉唑和其他亚砜类药物

DOI: 10.1007/s00253-021-11230-0 Applied Microbiology an…

ACS Catalysis:具备多底物特异性和对映立体选择性的新型麻黄碱脱氢酶的鉴定及研究

DOI: 10.1021/acscatal.9b00621 Tarek Shanati,Cameron Loc…

蛋白质聚集的分子动力学模拟

蛋白质聚集的分子动力学模拟 ( Molecular dynamics simulations of prote…

实验室常见杂菌

经常做微生物实验室的小伙伴一定有过这样的经历——染杂菌!!!这些杂菌颜色大小各不相同,有些可以明显区分有些则不…

计算机蛋白质设计的工具

近年来随着计算机运算能力的提升以及先进算法的涌现,计算机辅助蛋白设计逐渐成为蛋白质工程的研究热点。其中DBTL…

GROMACS蛋白配体模拟:配体使用amber GAFF力场

软件与材料 本文内容使用到如下软件: Ambertools 20 GROMACS 2019.5 Gaussia…

GROMACS蛋白配体分子动力学模拟预处理过程简要笔记

体系说明 本文主要针对蛋白配体模拟体系的预处理过程做一个简短的记录。体系中包含一个蛋白质,六个初始位置不同的配…

GROMACS蛋白配体分子动力学模拟结果分析简要笔记

0. 引言 本文以前文为基础,对蛋白配体复合物分子模拟体系的结果进行一系列的粗浅分析,本文记述了简要的分析方法…

RT-PCR从实验到写作,零基础教程

PCR,相信我们都不陌生,是一种选择性体外扩增DNA或RNA片段的方法,即通过试管中进行的DNA复制反应,使极…

制造业的未来取决于生物技术

作者:John Cumbers,SynBioBeta的创始人及CEO。SynBioBeta是合成生物学领域的学…

新型冠状病毒检测技术

新型冠状病毒的特征 在具体介绍检测方法之前,有必要介绍下病毒本身。新型冠状病毒,世界卫生组织(WHO)最近将其…

传说中的RNA PULL DOWN是啥?

在这段不得不在家充电的非常时期,小编无意中看到一种叫做RNA pull-down的实验技术,估计有很多小伙伴和…

蛋白-DNA互作三驾马车之染色质免疫沉淀ChIP技术

我们经过系统的学习和整理发现研究蛋白-DNA互作共有三种应用广泛的技术,我们姑且称之为蛋白-DNA互作三驾马车…

基于体外合成生物学的糖类药物高效合成与创新

摘要: 蛋白质,DNA和糖分子并称为生命三大物质,糖类及含糖分子在药物领域有着重要的地位。但是目前制约糖类药物…

Design and use of de novo cascades for new benzylisoquinoline biosynthesis

摘要: 苄基异喹啉生物碱是一类具有化学结构多样性的化合物,存在于开花植物的次级代谢产物中。目前已知的苄基异喹啉…

trRosetta: 在台式机上从头折叠一个蛋白——这台台式机最好有一块好显卡

作者: 刘源 北京大学化学与分子工程学院-王初题组特聘博士后 一、前言 去年CASP上AlphaFold打败了…

再创丨利用二氧化碳作为唯一碳源的自养型大肠杆菌诞生

在生命进化的历史长河中,从第一个生命诞生开始到第一个可以利用二氧化碳的自养型生命出现一共经历了多久的时间?答案…

如何选择用于分子对接的蛋白晶体结构

在使用殷赋云计算平台的时候,有不少用户对于如何选择蛋白晶体结构存在疑问。本篇就这个话题做一些经验分享。任何标准…

将X-ray小角度散射与计算机模拟结合来进行蛋白结构研究

摘要:晶体学,冷冻电镜以及NMR是传统蛋白结构研究的三座大山,而随着计算机蛋白模拟技术的迅猛进步,使得x-ra…

不得不知道的免疫组织化学常见问题及处理方法

免疫组织化学(Immunohistochemistry, IHC)是免疫染色最常见的应用,其原理是利用抗体与生…

开发理性设计方法用于酶分子改造

【摘要】 定向进化和理性设计是两种常见的酶分子改造策略。定向进化策略已经被成功应用于酶活性、稳定性、底物特异性…

如何应用质谱仪进行氨基酸序列测定

第一步是蛋白酶切(Digestion) 成肽段 其中最常用的是胰蛋白酶,它在精氨酸(Arg)和赖氨酸(Lys)…

表观遗传学的神奇世界

“表观遗传”使获得性遗传再次引起科学家的兴奋,它已成为生命科学界最热门领域之一。以DNA为载体的中心法则仍是传…

如何选择离子交换色谱来纯化蛋白?

现如今,无论是实验室需要,还是在蛋白类产品在工业制备和生产的过程中,蛋白表达后进行提取纯化是非常重要的一个过程…

细胞转染方法及脂质体介导法

细胞转染是指将外源核酸物质(DNA或者RNA)输送至真核细胞内部的技术,以进行多种细胞生理和生化的研究,包括:…

Protonation state, binding affinity and conformational change, what can free energy computation tell us

嘉宾:邬知易博士,牛津大学 主持人:于浩然 时间:2019年8月20日晚8点 摘要: 随着计算成本的不断降低与…

计算机辅助酶设计—基于酶催化循环的软件工具介绍

嘉宾:蒲中机 博士,大连理工大学 主持人:汤文 摘要: 酶作为理想的催化剂,显示出显著的反应速率、高立体化学和…

蛋白表达纯化之通关技巧

拿到一个蛋白以后,首先需要对蛋白进行全面的了解,所谓知彼知己方能百战不殆: 1. 蛋白二级结构预测:蛋白质的二…

一文详细了解双特异性抗体

目前癌症免疫治疗的有力工具包含单克隆抗体、肿瘤疫苗、免疫检查点抑制剂、CAR-T细胞免疫疗法以及双特异性抗体(…

【实用干货】如何上传数据至NCBI?

高通量测序结束之后,想要发表文章,除了要面对数据分析这一难题,还需要将测序数据上传至NCBI。 上传到NCBI…

关于蛋白标签的那些事

蛋白标签(protein tag)是指利用DNA体外重组技术,与目的蛋白一起融合表达的一种多肽或者蛋白,以便于…

【详述】蛋白质标记策略

蛋白质标记的主要目的是监测生物过程、辅助检测(例如化合物的可靠定量、蛋白质修饰的特异性检测)或者纯化标记后的蛋…

Rosetta Cartesian_ddG: 更快更准确的蛋白质稳定性预测方法

前言 计算单点突变自由能是分子稳定性改造的”老套路”。FoldX以及ddg_monom…

号外 | 王初课题组与陈鹏课题组合作开发通用活体蛋白激活技术

近日,本课题组与北京大学化学与分子工程学院陈鹏课题组合作,在Nature杂志上发表题为“Time-resolv…

基于遗传密码子扩展技术研究蛋白-蛋白相互作用

蛋白-蛋白相互作用在生命活动中扮演十分重要的角色,研究蛋白-蛋白相互作用将有助于阐明特定生命过程及为相关疾病的…

高质量PyMOL作图教程

高质量PyMOL作图教程

前言 上一期,小编教大家使用殷赋云计算平台(http://cloud.yinfotek.com)重现了一篇20…

【文献重现】D715-2441 抑制剂与PB2蛋白的结合模式研究

【文献重现】D715-2441 抑制剂与PB2蛋白的结合模式研究

【前言】 从本期起,小编将带领大家使用殷赋云计算平台(http://cloud.yinfotek.com/)来…

师兄,为什么我的细胞培养液是紫红色?

实验室新来了一个师弟,老板让其从养细胞开始。这个小师弟是个夜猫子,总喜欢深夜做实验。一天早上: 小师弟: 湿胸…

研究生第一篇学术论文常犯问题总结

在过去几个月里面,我帮助不少研究生修改过学术论文。其中有一些人的论文的研究内容和结果非常好,但是,在他们论文撰…

电脑中有这两个P就可以搞定WB

论文撰写这件事情看似很高大上,但是有些图片只需常备软件就可以处理的很好,今天给大家介绍两种简单易学处理WB图片…

工程化改造哺乳动物细胞用于疾病诊断和治疗的设计策略

原文以 Engineering mammalian cells for disease diagnosis a…

How Enzymes Work? 酶是如何工作的?

干货 | 实验篇之荧光定量 PCR(下)

前面给大家着重介绍了 qPCR 的实验流程和注意事项【干货 | 实验篇之荧光定量 PCR(上)】想必大家意犹未…

实验技巧之WB篇

关于蛋白质免疫印迹(Western Blot,即 WB),想必做蛋白实验的小伙伴们都不会陌生,作为免疫学中最常…

综述丨靶向肿瘤免疫微环境的肿瘤免疫疗法

肿瘤严重影响人类的健康,是人类的第二大杀手。肿瘤的形成可分为两个层次,第一个层次是一个正常的细胞变成一个肿瘤细…

年终盘点:Tolobio评选的2018年度合成生物学十大进展

2018年年底,Science杂志评出了这一年的10大年度进展。在这里,小编总结了合成生物学研究领域的10大进…

技能篇 | IHC之路漫漫(下篇)

在上期:IHC之路漫漫(上篇)中,我们的实验达人对在IHC实验中,实验结果如何分析、Triton X-100的…

技能篇 | IHC之路漫漫(上篇)

路漫漫其修远兮,吾将上下而求索。 一入科研深似海,从此自由是路人。 在实验室待的越久,越感觉自己知道的少,实验…

干货 | 实验篇之荧光定量 PCR(上)

哈喽啊~小编又来了…了…了…作为一名认真的科研狗,今天要继续给大家分享科研…

小程序| 最好用的SCI期刊分区和影响因子查询工具

广大医学科研人员将多年的临床心血化为一篇论文之后,最重要的阶段就是选择合适的SCI期刊发表。但如何找到合适的期…

从实验室走向大众,一文读懂Nanopore测序技术的发展及应用

随着基因测序技术不断突破,二代测序的发展也将基因检测成本大幅降低。理想的测序方法,是对原始DNA模板进行直接、…

我在美国做基因检测(下)之个人特征报告

距离该系列的第一篇文章发布,已经匆匆几月。感谢大家一直以来的支持和私信。让小编在基因检测的科普道路上越走越来劲…

干货—技能篇之分子生物学常用小软件分享

作者:唐琦 哈喽,小编又来了,继上周的干货篇【请戳右边:干货 | 实验篇之RT-PCR 】,我们继续给大家分享…

干货 | 实验篇之RT-PCR

作者:高天政 逆转录实验作为是常见的分子生物学实验之一,虽然看上去步骤简单,但当你实际操作时就会发现各种问题扑…

最新综述长文:合成生物学应用趋势

摘要:合成生物学工具和技术的最新发展推动了用于人类健康、农业、环境管理和其他目的的各种产品的商业化。 本文回顾…

善用ResearchGate做学术

ResearchGate有没有听过? 国内,有一部分人对这个网站比较了解,但大部分人可能对这个网站可能没那么了…

我在美国做基因检测(下)之健康报告

上一篇小编详细讲述了23andMe基因检测报告的第三大类报告中的遗传健康风险报告。小编认为这是所有现有基因检测…

荧光蛋白与发荧光的蛋白不一样

所有的蛋白都可以发出荧光,但并不是所有的蛋白都叫作荧光蛋白。就像”并不是所有的牛奶都叫特仑苏&#8…

我在美国做基因检测(下)之遗传健康风险报告

上一篇小编详细讲述了23andMe基因检测报告的第二大类报告:突变携带者报告。今天,我们来看小编基因检测结果报…

干货 | 诺奖技术:噬菌体展示技术详细解读

当2018年诺贝尔化学奖颁布的那一刻,我禁不住高呼一声:今年的三大自然科学奖项都被生物学给“收入囊中”了。别的…

干货 | 本期没有贺建奎,我们只讲基因编辑

前言 近期,基因编辑婴儿、贺建奎类似话题占满了新闻、微博,各大网站,但作为一个紧跟生物热点,严肃而又不失严谨的…

入坑PhD前的20条建议!

有人曾说博士是一场孤独的修行。确实,选择读博也就意味着选择要在未来3-5年内,或者更长的一段时间内,就必须要成…

荧光定量PCR应用之污染篇

概述 实时荧光定量PCR (Real-time quantitative Polymerase Chain R…

RNA反转录的六大要素

老话说的好,万事开头难。而这话在RT-PCR中则体现的淋漓尽致,其开头的第一步——将RNA反转为cDNA,表面…

怎么样读文献才比较高效

我读书的时候每次看英文文献,都在心里告诉自己: 平时读英文文献已经很麻烦了,如果不趁着我难得看一次的机会多学点…

几种常用的蛋白标签的功能和优点

重组蛋白表达技术现已经广泛应用于生物学各个具体领域。特别是体内功能研究和蛋白质的大规模生产都需要应用重组蛋白表…

分子对接简明教程

1. 分子对接(molecular-docking)理论 所谓分子对接就是两个或多个分子之间通过几何匹配和能量…

表观遗传你了解多少?

经典的遗传学(Genetics)无法解释同卵双胞胎为何长相并非一模一样,克隆三花猫为何毛色不一致,因为这些变化…

诺贝尔化学奖:酶分子定向进化,这是什么技术?!我来告诉你!

2018年10月3日瑞典当地时间中午,北京时间下午5:45,2018年诺贝尔化学奖颁给了三名生物化学专家。 美…

实验 | RNA提取实验中的那些玄学

当年还是新手的时候,曾经在网上读过不少关于提取RNA心得体会的文章。如今从事科研已经十年有余,现在回过头再去读…

10步填上免疫组织化学 (IHC) 的坑

免疫组织化学 (Immunohistochemistry,IHC) 或免疫细胞化学(Immunocytoche…

我在美国做基因检测(下)之突变携带者报告

之前的文章中我们详细讲述了23andMe基因检测过程以及检测报告五大类之首:祖源分析。我们今天来看第二大类报告…

Western blot离完美总差一步,可能因这7个小误区

遥想当年,小编初接触WB时,只顾一味瞎折腾,完美地避开了所有正确操作,以至于每次做完该实验,就觉得自己的血槽已…

学术干货 | 核磁共振好基友MestReNova—手把手教你做出一张核磁谱图

核磁共振(NMR,Nuclear Magnetic Resonance)是基于原子尺度的量子磁物理性质。具有奇…

几种常见有机物在气相色谱-质谱联用(GC-MS)检测中的衍生化方法简介

作者:徐凡, 苏州大学化学化工学院;姚志刚 , 苏州大学分析测试中心 自 1957 年 J. C. Holme…

手把手教你做ChIP实验

表观遗传学作为近10年来炙手可热的方向,其研究已经深入到各个学科和领域,促进了医学,动物学,植物学,生殖发育等…

不可不知的生物药分析检测方法之SPR技术

近年来,全球生物制药发展异常迅猛,新的生物药分析检测技术亦层出不穷,SPR技术作为其中一员,凭借着其突出的准确…

电转化的一些技巧与经验

原文链接:https://international.neb.com/tools-and-resources/…

如何在Rstudio中运用Git进行版本控制

Warning:以下内容基于笔者本人使用的Win10操作系统编写。 前言 R语言是进行生物信息学数据分析工作的…

如何制作文章中的Figures

首先,明确一下,此文所说的图不是软件导出的图,也不是荧光显微镜拍下的图,而是最终呈现在发表的文章中的Figur…

ELISA老不成功,究竟错在哪儿?

ELISA素来以灵敏度较高、特异性较好的特点在临床上得到了广泛的应用。而它作为经典的免疫检测方法,虽然看似平常…

CHO细胞的江湖

哺乳动物细胞具有和人类相似的复杂翻译后修饰,常被用来表达具有活性的生物大分子蛋白。而这些生物大分子的功能发挥在…

除了KEGG,这些信号通路研究的数据库你造么?(附通路绘画常用软件)

信号通路作为细胞内活动的真实写照,素来都是分子机制研究的重头戏,因而无论是高分文章还是申请基金,都少不了要抱抱…

改造蛋白质机器:合成生物学的新兴工具(Part I)

编者的话·写在前面 大自然已经发展出了一系列错综复杂的由蛋白质装配而成的分子机器,这些机器一起完成了维持生命的…

我在美国做基因检测(下)之祖源分析

在经历了漫长的等待,在辞旧岁迎新春之际,23andMe终于把小编的基因检测报告发送过来了!激动! 虽然时隔8周…

我在美国做基因检测(中)

上一篇文章“我在美国做基因检测(上)”中谈到了一些问题,比如基因检测到底是检测什么的?如果我要做基因检测都需要…

【干货】细胞凋亡的形态学检测方法

导读 细胞凋亡的早期形态学改变是核染色质浓聚、固缩,聚集在核膜周边,然后是胞浆浓缩、胞膜起泡,继而细胞核裂解成…

【一点经验】关于植物组织培养的小技巧

什么是PTC? Plant Tissue Culture is a collection of techniq…

我在美国做基因检测(上)

听说基因检测最近很火? 2013年5月14日,著名影星安吉丽娜·朱莉在《纽约时报》发表了一篇名为“My Med…

如何解决冷冻电镜(cryo-EM)中最头痛的取向优势?

冷冻电镜单颗粒分析从二维投影图获得三维密度图有一个基本前提:获得具有足够取向的全同颗粒。这个“足够取向”一般而…

Cryo-EM 初学者入门资料集锦

本文由清华大学 宋文飞整理 书籍: 冷冻电镜相关书籍: 《Three-Dimensional Electron…

CAR-T免疫疗法是否预示着癌症将被彻底攻克?

CAR-T技术,一种免疫治疗技术,一种或许能治愈癌症的技术,你或许听说过,或许没听说过,但它确实给我们带来了惊…

【细节】实验中的“气泡君”

生物技术相关实验多是在液相中进行。液体中混入气体,很容易产生气泡。分子生物学等实验是非常精细的,很多时候这些不…

【一点经验】关于ChemDraw的几个使用技巧

Wikipedia ChemDraw is a molecule editor first developed…

通过这篇,我们一起来了解3D细胞培养技术

细胞在平面上生长是人为的和不自然的,因为这与细胞能够以最佳状态进行旺盛生长的体内环境并不相同。因此,传统的2D…

【简述】相对定量法分析qRT-PCR数据

qRT-PCR想必很多人都不陌生。小C之前做了长达一年的相对定量,也还是迷迷糊糊的。但是做实验怎么可以迷迷糊糊…

如何在PubMed中查询基因信息 | 转录本以及CDS查询

今天我们系统的为大家讲解一下如何以正确的姿势查询一个基因的转录本和CDS区. 首先打开PubMed:https…

关于核磁共振波谱NMR,你想知道的都在这里了

核磁共振波谱法(Nuclear Magnetic Resonance,简写为NMR)与紫外吸收光谱、红外吸收光…

ProtParam预测蛋白质基本理化性质

蛋白质理化性质是蛋白质研究的基础,我们先来看看蛋白质的基本性质有哪些。 蛋白质的基本性质 相对分子质量 氨基酸…

如何稳定保存RNA和定量?

DNA(RNA)定量分析可用紫外光谱分析,原理是DNA(RNA)分子在260nm处有特异的紫外吸收峰,且吸收强…

如何保存纯化后的蛋白质?

分子生物学实验室的童鞋们一定都或多或少跟蛋白质纯化打过交道。蛋白质纯化后,大家是如何保存的呢?有没有遇到过不同…

那些应用在实际生活中的生物催化酶

䊈,或作酶,酒母也。 《四库全书♦五音集韵》 现代产业对酶的解释,肯定不是指酵母菌,而是指具有催化功能的蛋白质…

20款生物在线工具汇总

今天小编就为大家整理了一个生物在线小工具的汇总,20款常用生物在线小工具,看看你能用到哪个。 1、Promot…

Cytoscape的“傻瓜式”教程

在这个世界,一个人的颜值和内涵很重要;在科研界中,优秀的科研论文除了创新的研究内容外,也需要“高颜值”的数据结…

不谈原理谈技术:qRT-PCR怎样才能做到“三线合一”

实时荧光定量PCR(qRT-PCR)是分子实验室家喻户晓的基因表达定量技术。无论是刚入实验室的菜鸟,还是久经沙…

一文教你如何从细胞中提取高质量RNA

在实验室中,尤其是分子生物类的实验室中不可避免的会遇到细胞总RNA提取实验,所提RNA样品的质量和纯度直接影响…

三种同源建模方法的比较

酶的结构决定功能,这通常是酶工程中的关键思想,其中的目标就是理解结构和功能关系,而最主要的就是获得酶的结构。当…

一文了解质粒的常用组成元件

1952年,美国的生物科学家Joshua Lederberg第一次引进了质粒(plamid)这一术语,用来表示…

五分钟看懂CRISPR/CAS技术

最热门的基因编辑技术CRISPR/Cas9势必会带来生物研究的革命。只需五分钟,本文将带你快速入门CRISPR…

CRISPR-Cas9全程实操教程:从gRNA设计到挑单克隆全程指导

基本原理 CRISPR-Cas9是一种细菌获得性免疫,用于降解入侵的外源DNA。CRISPR RNA (crR…

如何使用Primer5进行引物设计

质粒构建第一步就是设计引物。首先大体了解一下引物设计的一些通用原则: 1. 引物长度一般在15~30 bp,最…

H指数:当代科学工作者学术水平的综合评价指标

在申请基金、选择导师、合作者和招聘科研人员等多个方面都需要判断科研人员的学术水平。小编今天向大家介绍一个评价科…

实用SCI绘图教程|用Photoshop处理Western Blot条带

SCI绘图中最基本的绘图可能就是Western blot条带绘图了,但凡涉及到分子机制的文章中少不了Weste…

琼脂糖凝胶电泳,快来看各种细节~

凝胶电泳(gel electrophoresis)算得上是分子生物实验中最常见的技术了。在实验室里,我们常常称…

分子生物实验室常用的小公式

老师从小就教导我们:“先把数据算算对,再去做实验!还有,说的就是你啦,别忘了单位!”。不知道长做分子生物实验的…

一文教会你查找基因的启动子、UTR、TSS等区域以及预测转录因子结合位点

基础知识 首先我们了解一些基础知识启动子(promoter):与RNA聚合酶结合并能起始mRNA合成的序列。 …

蛋白质组学及蛋白质鉴定常用的网站和数据库

蛋白质数据库 1.UniProt (The Universal Protein Resource) 网址:ht…

培养细胞污染了怎么办?一起来看看预防污染的措施

体外培养的细胞受到严重污染时,有时即使想尽各种办法也难以挽回。因此,防止污染,预防是关键。只有将预防措施贯穿于…

你离学霸又近了一步——如何用excel画基因芯片数据热力图?

1首先我们通过一些方法得到了如下的数据,基于篇幅以及为了教学隐去了其他一些信息。 2选中表达数据,执行 开始—…

手把手教你用PPT绘制科研中各种图形(2)——蛋白酶体/管状结构

上图为我们绘制的最终效果。 我们来分析下上面的构造,其实就是圆形组成的图片,加上白色的渐变看上去有点立体效果,…

手把手教你用PPT绘制科研中各种图形(1)——DNA双链

今天,一步一步教大家如何绘制DNA。 1用矩形工具画一个矩形如下,线条颜色设置为无,填充色如下图蓝色 2选中矩…

如何用Pymol做出那些美呆的结构图(晋级篇)

上一次的文章,我们介绍了Pymol的一些基础界面操作,点这里。今天我们主要了解一下Pymol的一些基本命令操作…

氨苄筛选为什么不靠谱?

做分子生物的同学肯定对氨苄西林(Ampicillin)并不陌生。在大肠杆菌及其他细菌中进行基因克隆与蛋白表达的…

能不能成为好蛋白,生活环境很重要

和蛋白打了好些年的交到,也多少了解了些他们的脾气,他们有些时候确实敏感细腻,稍有招待不周,就集体罢工、组团报废…

质粒的前世今生—不同质粒之间的兼容性

在上两期文章中,我们聊到了质粒的复制源序列(戳这里 )和复制数量的调控(戳这里 ),现在来到了质粒系列的最后一…

拿什么拯救你-实验重复性

小编最近逛知乎遇见一个有趣的问题,“在实验室里有哪些非常容易学到的小技巧可以提高工作效率?”小编认为,效率很大…

做PCR 时降低污染的小方法

1 戴最合适的实验手套: PCR实验中一个主要的污染来源其实就是实验手套经常接触PCR 管口。即使你觉得自己好…

蓝白斑筛选,一种很炫的东西

分子克隆实验是分子生物学中常见的一个实验。感兴趣的基因插入到表达载体中,而后转化进入宿主内,但是并非所有质粒都…

Western Blot 常见问题和处理方法

Western blot 结果中背景较高 (high background): 膜封闭不够/封闭液 (bloc…

关于Bradford Assay, 你可能不知道的事

Bradford方法是最常用的蛋白质定量方法之一。其原理很简单,棕色染料考马斯亮蓝G250与蛋白质结合形成蓝色…

DNA染色,你用什么方法?

DNA是无色的,所以我们想要看见它们,就要用到染色技术。自PCR技术成熟之后,DNA染色法被大量开发,我们想用…

看了这篇文章,成为细胞裂解达人

通过裂解细胞来提取其中的物质是分子生物学中很常见的步骤,裂解方法也是种类繁多,可以用化学试剂、声波震荡、甚至机…

切胶回收的注意事项

在分子克隆里,大家不要小看了切胶回收(gel extraction)这一步骤,过低的DNA浓度和质量往往会直接…

提取质粒DNA和基因组DNA的区别

在分子生物实验室中,我们常用各种试剂盒(e.g. QIAGEN mini/midi/maxi prep)做质粒…

质粒提取试剂盒中各溶液配方及作用

提质粒是分子生物学中最基本,最easy的实验。完全不需要借助大脑,直接照着提取试剂盒中的操作说明傻瓜操作即可。…

提纯你的DNA样本,很急、很关键!

在分子生物学实验中,提纯DNA样本是十分常见的步骤。纯净无杂质的DNA有助于下一步或几步实验的发生和成功。有时…

细说小分子短肽标签(三)之Strep-Tag II

在分析蛋白质的结构和功能时,最重要的是如何得到高纯度的蛋白。现今最常用的方法就是亲和标签系统,已经成为重组蛋白…

细说小分子短肽标签(二)之FLAG-Tag

在分析蛋白质的结构和功能时,最重要的是如何得到高纯度的蛋白。现今最常用的方法就是亲和标签系统,已经成为重组蛋白…

细说小分子短肽标签(一)之His-Tag

在分析蛋白质的结构和功能时,最重要的是如何得到高纯度的蛋白。现今最常用的方法就是亲和标签系统,已经成为重组蛋白…

定点突变常见问题及对策

定点突变并不是一个复杂的实验(原理可见文章定点突变简说),然而有时候我们在实验中却会遇到各种各样的问题。一些常…

QuikChange定点突变方法简说

定点突变技术是指通过聚合酶链式反应(PCR)等方法对DNA片段中特定位置碱基进行替换,删除或添加新的碱基的技术…

微生物内进行蛋白质表达前需要考虑的8件事

在微生物内进行蛋白质表达是生物科技中的核心技术。然而,每种蛋白质都具有其独特的结构性质,比如二硫键(disul…

培养大肠用什么培养基?只知道LB你就out了

大肠杆菌(Escherichia coli,E.coli)是与我们人类关系最为密切的细菌之一,是人和动物肠道中…

Nanodrop经验谈

Nanodrop是实验室中常见的分光光度计。与传统需要比色皿的分光光度计相比,Nanodrop所需样品的体积大…

犯罪现场调查之法医DNA分析技术

在各色各样的探案类型电视剧中,除了思维敏锐、身手不凡的探长外,都或多或少有提到一个叫“法医法证(Forensi…

浅谈ELISA的那些事儿

酶联免疫吸附试验(Enzyme-linked immunosorbent assay,简称ELISA)是一种基…

有了QIAGEN三大哥,再也不怕DNA提取啦~~~

做过分子实验的童鞋也许听说过甚至用过QIAGEN的产品,特别是那些用于DNA提取、提纯的试剂。QIAGEN是一…

三种常用的蛋白质浓度测定方法

对很多人来说,检测蛋白质的浓度实在不是多困难的实验。但有时我们也不能太过自信,因为即使最简单的方法都有其复杂的…

自己变身机器猫,口袋里装下世上所有的信息!

在写这篇文章的时候,小编上网查询了下,发现目前市场上在卖的比较强大的台式机的硬盘可以储存6TB的数据,由于化学…

单克隆抗体糖基化与糖基化工程抗体 (下)

重组抗体Fc段聚糖链结构(图中实线为基础糖骨架,虚线为或有或无的糖残基链) 继在上篇中向大家介绍了单克隆抗体的…

单克隆抗体糖基化与糖基化工程抗体 (上)

自从人们发现单克隆抗体(MAbs)的应用价值后,它已被广泛的应用于科学研究及临床疾病的治疗中。目前MAbs主要…

如何让你的酶切反应“时半功倍”?

限制性核酸内切酶(以下简称限制性酶)是一类识别双链DNA中特定核苷酸序列的DNA水解酶,以内切方式水解DNA,…

Western Blot 中你不可不会的剥离技术

Western Blot的过程复杂繁琐,大家难免会在实验中遇到一些问题。而且整个实验耗时较长,所以我们要尽可能…

开启蛋白质印迹法成功大门的第一把钥匙

蛋白质印迹法(免疫印迹试验)即Western Blot是分子生物学、生物化学和免疫遗传学中常用的一种实验方法。…

看完这篇文章,不要再傻傻分不清nitrocellulose和PVDF

在做Western Blot的时候,膜的选择是整个实验的一个关键点,所以大家要谨慎选择。毕竟它是一个物理支撑物…

DNA测序技术的发展:第三代测序技术

本文作为DNA测序的最终章,就和大家聊一聊最新一代的DNA测序技术。不相同于上两篇文章中提到的桑格法测序和SB…

DNA测序技术的发展:第二代SBS技术

在上一篇文章中,小编提到的初代桑格测序法,兴起于上世纪七十年代,发展到现在已经不能算是主流的测序技术了,但桑格…

DNA 测序技术的发展:初代桑格法

从1977年第一代DNA测序技术(桑格法),发展至今将近四十年时间,测序技术已取得了相当大的发展。虽然就当前形…

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