蛋白质工程 – BioEngX

Nature | 机器学习辅助改造PET水解酶

2022年4月，德克萨斯大学奥斯汀分校Andrew D. Ellington团队和Hal S. Alper团队…

生物催化剂 • 2022-11-16 472赞 197阅读 3,894评论

Nat.Commun. | 嵌合体翻译系统的定向进化，可用于高效的整合非天然氨基酸以及营养缺陷型菌体的构建

2021年12月，浙江大学林世贤团队在Nature Communications发表题为“Directed-e…

合成生物学 • 2022-10-21 470赞 19阅读 2评论

Nat. Catal | 人工酶中两个非生物催化位点同时作用的协同催化反应

本周为大家介绍一篇2020年发表在Nature Catalysis的文章：人工酶中两个非生物催化位点同时作用的…

生物催化剂 • 2022-07-22 495赞 26阅读 28评论

ACS Catal. | 机器学习引导的酶定向进化文库设计：训练集组成对序列空间探索的影响

2021年11月，东京大学Koji Tsuda团队和日本东北大学Mitsuo Umetsu团队共同在ACS C…

生物催化剂 • 2022-07-11 480赞 24阅读 27评论

ACS Catal. | 深度序列−功能表征揭示增强酶活性的多种途径

2022年2月，塔夫茨大学化学与生物工程系的NikhilU. Nair教授团队在ACS Catalysis上发…

生物催化剂 • 2022-06-19 472赞 18阅读 31评论

Angewandte. |通过减少酶表面的不利盐桥增加有机溶剂耐受性

德国亚琛大学报告了一种智能盐桥设计策略，同时提高模型酶枯草杆菌脂肪酶A（Bacillus subti…

生物催化剂 • 2022-05-23 515赞 18阅读 28评论

利用分隔式自我复制（CSR）改造来自于Thermus thermophilus的I型DNA聚合酶

在基因元件（例如DNA聚合酶）的定向进化中，CSR（分隔式自我复制）和CPR（分隔式同伴复制）是一类重要的方法…

生物催化剂 • 2022-04-23 471赞 34阅读 47评论

Nat. Commun. | 用于遗传密码扩展的吡咯赖氨酰-tRNA合成酶/tRNA对和经典合成酶/tRNA对的嵌合设计

文章链接：https://www.nature.com/articles/s41467-020-16898-y…

化学生物学 • 2022-04-09 511赞 41阅读 32评论

ACS Catal. | 基于GRAPE策略的计算设计实现温和条件下塑料生物降解

2021年1月，中国科学院微生物研究所的吴边团队在ACS Catalysis上发表文章提出了一种新型蛋白质稳定…

生物催化剂 • 2022-04-01 494赞 17阅读 30评论

Nuture | 一种具有非标准有机催化机制的酶的设计和进化

2019年6月，曼彻斯特大学生物技术研究所Anthony P. Green团队在Nuture上发表了题为“De…

化学生物学 • 2022-03-16 488赞 18阅读 33评论

利用非天然氨基酸起始蛋白的翻译

今天给大家介绍一个合成生物学中比较有意思的研究–利用非天然氨基酸起始蛋白的翻译。 2019年12月…

合成生物学 • 2022-03-10 484赞 26阅读 31评论

氨酰-tRNA合成酶的持续定向进化

2017年11月16日，David Liu（刘如谦）研究团队在Nature Chemical Biology …

生物催化剂 • 2022-01-09 581赞 38阅读 26评论

Cell Chemical Biology：通过光响应性非天然氨基酸来光控酶的变构

大家好，今天分享一篇2019年发表在Cell Chemical Biology的文章，题目是“Light Re…

生物催化剂 • 2021-11-26 435赞 2,210阅读 24评论

计算机蛋白质设计的工具

近年来随着计算机运算能力的提升以及先进算法的涌现，计算机辅助蛋白设计逐渐成为蛋白质工程的研究热点。其中DBTL…

工具使用 • 2021-07-27 795赞 58阅读 28评论

开发理性设计方法用于酶分子改造

【摘要】定向进化和理性设计是两种常见的酶分子改造策略。定向进化策略已经被成功应用于酶活性、稳定性、底物特异性…

生物信息学 • 2019-10-27 1.03K赞 100阅读 33评论

号外 | 王初课题组与陈鹏课题组合作开发通用活体蛋白激活技术

近日，本课题组与北京大学化学与分子工程学院陈鹏课题组合作，在Nature杂志上发表题为“Time-resolv…

化学生物学 • 2019-05-12 1.08K赞 88阅读 32评论