蛋白质稳定性预测工具-Rosetta ddg_monomer

蛋白质由于其来自于生命体的本质,在工业环境下通常是不稳定的。暂不提高温高压或者含有有机溶剂的极端环境,就是在室…

如何根据靶点蛋白质结构设计药物

编者按   本文作者目前所在课题组是DOCK软件主要开发组之一。DOCK是世界上第一款模拟分子对接的软件,也是…

蛋白质三维结构比较——如何深度地挖掘进化信息

蛋白质序列的比较很是常见,可用的工具也有很多,可以参考我们早前的推文 。当两条蛋白质序列的相似度大于30%时,…

如何制作黑白色的保守序列

在生物学中,保守序列(conserved sequence)是指在核酸序列/蛋白质序列/蛋白质结构/多聚糖序列…

虚位以待

如何用Pymol做出那些美呆的结构图(晋级篇)

上一次的文章,我们介绍了Pymol的一些基础界面操作,点这里。今天我们主要了解一下Pymol的一些基本命令操作…

如何用Pymol做出那些美呆的结构图(基础篇)

小伙伴们在阅读文献的时候是不是经常会看到那种美呆了的蛋白质结构图,比如这样的、这样的、还有这样的: 认真的小伙…

一网打尽Km测定方法

研究酶的科研汪们都知道,无论是表达一种新酶,还是工程一个现有的酶,都需要对酶的一系列特性进行表征。在表征酶功能…

蛋白质结构PDB文件详细解释

蛋白质数据库Protein Data Bank(PDB)是一个包含蛋白质、核酸等生物大分子的结构数据的数据库,…

Km, Kcat 傻傻分不清楚?

研究酶的科研汪们都知道,无论是表达一种新酶,还是工程一个现有的酶,都需要对酶的一系列特性进行表征。小编上期已经…

明胶酶谱101

酶谱(zymography)是一项通过底物降解来分析蛋白酶活性的技术。明胶酶谱法被广泛地用于明胶酶A(MMP-…

用来表征酶功能的一些参数介绍

酶是存在于生物体内的一种生物催化剂。和普通的化学催化剂一样,它可以提高化学反应的速度,但不能改变反应方向和反应…

Western Blot经验谈

本文为BioEngX-Western blot 科研讨论群第一次Study club的演讲报告,演讲人为来自英…

合成抗体知多少(二)

为了克服杂交瘤细胞生产单克隆抗体带来的一系列弊端,重组抗体(recombinant antibodies,rA…

蛋白质SASA/Depth计算方法

蛋白质的表面溶剂接触面积(Solvent Accessible Surface Area )是用来衡量蛋白质的…

蛋白纯化那些事儿

大家好,我是风烬辞,之前在《实验万事屋》这个公众号上发过若干文章的(目前合作已终止)、奖学金只有一块钱(还没给…

合成抗体知多少 (一)

相信大家对单克隆抗体 (monoclonal antibodies,mAbs)一定不陌生,而且不少实验需要用到…

蛋白质纯化后分析技术

很多研究工作都需要对蛋白质进行纯化,只有经过纯化后的蛋白质方可用于后续的生物物理学,结构学,诊断治疗等方面的研…

Western Blot中的细节决定成败

相信很多同学还在纠结如何优化蛋白质印迹法(Western Blot, WB)的操作方法(protocol),那…

能不能成为好蛋白,生活环境很重要

和蛋白打了好些年的交到,也多少了解了些他们的脾气,他们有些时候确实敏感细腻,稍有招待不周,就集体罢工、组团报废…

Western Blot 常见问题和处理方法

Western blot 结果中背景较高 (high background): 膜封闭不够/封闭液 (bloc…

关于Bradford Assay, 你可能不知道的事

Bradford方法是最常用的蛋白质定量方法之一。其原理很简单,棕色染料考马斯亮蓝G250与蛋白质结合形成蓝色…

看了这篇文章,成为细胞裂解达人

通过裂解细胞来提取其中的物质是分子生物学中很常见的步骤,裂解方法也是种类繁多,可以用化学试剂、声波震荡、甚至机…

细说小分子短肽标签(三)之Strep-Tag II

在分析蛋白质的结构和功能时,最重要的是如何得到高纯度的蛋白。现今最常用的方法就是亲和标签系统,已经成为重组蛋白…

细说小分子短肽标签(二)之FLAG-Tag

在分析蛋白质的结构和功能时,最重要的是如何得到高纯度的蛋白。现今最常用的方法就是亲和标签系统,已经成为重组蛋白…

细说小分子短肽标签(一)之His-Tag

在分析蛋白质的结构和功能时,最重要的是如何得到高纯度的蛋白。现今最常用的方法就是亲和标签系统,已经成为重组蛋白…

浅谈ELISA的那些事儿

酶联免疫吸附试验(Enzyme-linked immunosorbent assay,简称ELISA)是一种基…

三种常用的蛋白质浓度测定方法

对很多人来说,检测蛋白质的浓度实在不是多困难的实验。但有时我们也不能太过自信,因为即使最简单的方法都有其复杂的…

单克隆抗体糖基化与糖基化工程抗体 (下)

重组抗体Fc段聚糖链结构(图中实线为基础糖骨架,虚线为或有或无的糖残基链) 继在上篇中向大家介绍了单克隆抗体的…

单克隆抗体糖基化与糖基化工程抗体 (上)

自从人们发现单克隆抗体(MAbs)的应用价值后,它已被广泛的应用于科学研究及临床疾病的治疗中。目前MAbs主要…

Western Blot 中你不可不会的剥离技术

Western Blot的过程复杂繁琐,大家难免会在实验中遇到一些问题。而且整个实验耗时较长,所以我们要尽可能…

开启蛋白质印迹法成功大门的第一把钥匙

蛋白质印迹法(免疫印迹试验)即Western Blot是分子生物学、生物化学和免疫遗传学中常用的一种实验方法。…

看完这篇文章,不要再傻傻分不清nitrocellulose和PVDF

在做Western Blot的时候,膜的选择是整个实验的一个关键点,所以大家要谨慎选择。毕竟它是一个物理支撑物…

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