您的位置 首页 生物催化剂

浙江大学于浩然课题组BA综述|让定向进化更容易的“热点”

来源: 遇见生物合成 发布: 2022-02-22 1,306阅读 159评论

近日，浙江大学化学工程与生物工程学院于浩然研究团队与伦敦大学学院Paul A. Dalby教授课题组合作撰写的综述性论文“Hot spots-making directed evolution easier”发表于国际生物技术顶级期刊Biotechnology Advances（IF14.2）。

为了加速蛋白质的进化，定向进化已经成为一种强大的策略，用于设计提升蛋白的特定性质。然而利用易错PCR，DNA shuffling等传统方法构建的突变体文库通常规模非常大，在没有高通量筛选方法的情况下，筛选这种文库是费时、费力和费钱的。另一方面，以结构或序列信息为指导的点饱和突变也已成为蛋白质工程的一种常用方法，该方法旨在构建“小而精”的突变体文库，进一步提高了定向进化的效率。该方法的前提是突变靶点预测是可靠的，突变靶点或热点位置（Hot spots）的预测对于文库的质量和定向进化的效果至关重要。

该项工作概述了可用于蛋白质进化的七种热点位置，主要分为两类：Ⅰ）基于序列的热点，包括CbD (conserved but different) 位点和共进化残基；Ⅱ）基于三维结构的热点，包括活性位点残基、通道位点、灵活位点、与活性中心“耦合”的远端位点和界面位点。热点位置的选择应基于所需改造的蛋白质特性和可用的结构信息进行（表1）。值得注意的是，这些热点只提供了潜在的突变目标，在实际情况中可能需要其他标准来缩小突变位点的范围。该项工作还对预测这些热点位置的计算工具及将其用于酶工程的许多成功案例进行了综述。

表1 热点位置选择指南

论文以浙江大学化学工程与生物工程学院为第一完成单位，论文中相关研究工作得到国家自然科学基金项目（22108245）的资助。

招贤纳士

于浩然博士，浙江大学“百人计划”研究员，博士生导师，浙江大学杭州国际科创中心青年人才卓越计划入选者。本科、硕士毕业于天津大学，博士毕业于伦敦大学学院，归国前就职于伦敦大学学院任博士后研究员。主要研究领域包括蛋白质工程，酶分子智能设计等，在PNAS，ACS Catalysis，Biotechnology Advances等期刊发表10余篇论文。主持国家自然科学基金青年项目、UCL-ZJU国际合作项目等，任英国皇家化学学会Associate member，中国生物工程学会合成生物学分会青年工作组委员等。现招聘酶工程、机器学习、计算机蛋白质设计相关方向博士后1-2名，欢迎感兴趣的同学提供个人简历（包括学习工作经历，主要研究工作，代表性论文等），发送至yuhaoran@zju.edu.cn。

 

745赞
标签:



相关文章

回复 Thfvkr 取消回复

您的电子邮箱地址不会被公开。 必填项已用*标注

评论列表(159)

  1. Этот информативный текст отличается привлекательным содержанием и актуальными данными. Мы предлагаем читателям взглянуть на привычные вещи под новым углом, предоставляя интересный и доступный материал. Получите удовольствие от чтения и расширьте кругозор!
    Все материалы собраны здесь – https://hoppinghawks.com/hello-world

    回复

  2. В этой информационной статье вы найдете интересное содержание, которое поможет вам расширить свои знания. Мы предлагаем увлекательный подход и уникальные взгляды на обсуждаемые темы, побуждая пользователей к активному мышлению и критическому анализу.
    Заходи — там интересно – http://radiosafinat.ru

    回复

  3. Этот информативный текст выделяется своими захватывающими аспектами, которые делают сложные темы доступными и понятными. Мы стремимся предложить читателям глубину знаний вместе с разнообразием интересных фактов. Откройте новые горизонты и развивайте свои способности познавать мир!
    Ссылка на источник – https://theshca.org.uk/temple-visit

    回复

  4. Этот увлекательный информационный материал подарит вам массу новых знаний и ярких эмоций. Мы собрали для вас интересные факты и сведения, которые обогатят ваш опыт. Откройте для себя увлекательный мир информации и насладитесь процессом изучения!
    Неизвестные факты о… – https://f5fashion.vn/update-unveiling-shad-thyrion-autopsy-startling-revelations

    回复

  5. Этот увлекательный информационный материал подарит вам массу новых знаний и ярких эмоций. Мы собрали для вас интересные факты и сведения, которые обогатят ваш опыт. Откройте для себя увлекательный мир информации и насладитесь процессом изучения!
    Подробнее – https://founderscribe.com/pharmacy-slogans-and-taglines

    回复

  6. Эта статья подробно расскажет о процессе выздоровления, который включает в себя эмоциональную, физическую и психологическую реабилитацию. Мы обсуждаем значимость поддержки и наличие профессиональных программ. Читатели узнают, как строить новую жизнь и не возвращаться к старым привычкам.
    Подробнее тут – https://nhl-news.ru/blog/kapelnicy-dlya-ozdorovleniya-sila-vitaminnoy-terapii

    回复

  7. Эта публикация дает возможность задействовать различные источники информации и представить их в удобной форме. Читатели смогут быстро найти нужные данные и получить ответы на интересующие их вопросы. Мы стремимся к четкости и доступности материала для всех!
    Читать дальше – http://www.mm-baitservice-blog.at/2018/03/01/37-2/bild3/?page_number_0=53

    回复

  8. Эта публикация дает возможность задействовать различные источники информации и представить их в удобной форме. Читатели смогут быстро найти нужные данные и получить ответы на интересующие их вопросы. Мы стремимся к четкости и доступности материала для всех!
    Ознакомьтесь с аналитикой – https://sun-catch.com/net-zero-solar-thermal-systems

    回复

  9. Эта публикация завернет вас в вихрь увлекательного контента, сбрасывая стереотипы и открывая двери к новым идеям. Каждый абзац станет для вас открытием, полным ярких примеров и впечатляющих достижений. Подготовьтесь быть вовлеченными и удивленными каждый раз, когда продолжите читать.
    Секреты успеха внутри – https://uniforme-eletricista-nr10.com.br/extraction-2020-download-torrent

    回复

  10. Этот информативный текст отличается привлекательным содержанием и актуальными данными. Мы предлагаем читателям взглянуть на привычные вещи под новым углом, предоставляя интересный и доступный материал. Получите удовольствие от чтения и расширьте кругозор!
    Не упусти важное! – https://drnatro.com/le-khai-mac-he-nam-2024

    回复

  11. Эта публикация завернет вас в вихрь увлекательного контента, сбрасывая стереотипы и открывая двери к новым идеям. Каждый абзац станет для вас открытием, полным ярких примеров и впечатляющих достижений. Подготовьтесь быть вовлеченными и удивленными каждый раз, когда продолжите читать.
    Погрузиться в научную дискуссию – https://ranchiarticle.com/planning-a-trip-here-are-the-most-important-10-dos-and-donts

    回复

  12. Этот текст призван помочь читателю расширить кругозор и получить практические знания. Мы используем простой язык, наглядные примеры и структурированное изложение, чтобы сделать обучение максимально эффективным и увлекательным.
    Все материалы собраны здесь – https://www.grill-center-bruehl.de/demo-screenshot

    回复

  13. В этой публикации мы предлагаем подробные объяснения по актуальным вопросам, чтобы помочь читателям глубже понять их. Четкость и структурированность материала сделают его удобным для усвоения и применения в повседневной жизни.
    Ознакомьтесь с аналитикой – https://babi-beauty.fr/meet-our-master-barbers-faces-behind-the-scissors

    回复

  14. Этот информационный материал собраны данные, которые помогут лучше понять текущие тенденции и процессы в различных сферах жизни. Мы предоставляем четкий анализ, графики и примеры, чтобы информация была не только понятной, но и практичной для принятия решений.
    Детальнее – https://maitodi.com/hello-world

    回复

  15. Этот увлекательный информационный материал подарит вам массу новых знаний и ярких эмоций. Мы собрали для вас интересные факты и сведения, которые обогатят ваш опыт. Откройте для себя увлекательный мир информации и насладитесь процессом изучения!
    Смотрите также… – http://isv-garden.ru

    回复

  16. Этот информативный текст отличается привлекательным содержанием и актуальными данными. Мы предлагаем читателям взглянуть на привычные вещи под новым углом, предоставляя интересный и доступный материал. Получите удовольствие от чтения и расширьте кругозор!
    Только факты! – http://zona-dle.ru

    回复

  17. В этой статье вы найдете познавательную и занимательную информацию, которая поможет вам лучше понять мир вокруг. Мы собрали интересные данные, которые вдохновляют на размышления и побуждают к действиям. Открывайте новую информацию и получайте удовольствие от чтения!
    Обратитесь за информацией – https://www.businesstalk.news/how-to-successfully-venture-into-the-construction-business

    回复

  18. Этот информационный материал собраны данные, которые помогут лучше понять текущие тенденции и процессы в различных сферах жизни. Мы предоставляем четкий анализ, графики и примеры, чтобы информация была не только понятной, но и практичной для принятия решений.
    Уточнить детали – https://upgear.digital/2021/07/11/custom-seo

    回复

  19. Этот текст призван помочь читателю расширить кругозор и получить практические знания. Мы используем простой язык, наглядные примеры и структурированное изложение, чтобы сделать обучение максимально эффективным и увлекательным.
    Изучить вопрос глубже – https://expertschoicellc.com/how-high-quality-banqueting-linen-enhances-guest-experience-event-success

    回复

  20. Эта публикация завернет вас в вихрь увлекательного контента, сбрасывая стереотипы и открывая двери к новым идеям. Каждый абзац станет для вас открытием, полным ярких примеров и впечатляющих достижений. Подготовьтесь быть вовлеченными и удивленными каждый раз, когда продолжите читать.
    Осуществить глубокий анализ – https://www.bellavistamall.do/hello-world

    回复

  21. В статье представлены ключевые моменты по актуальной теме, дополненные советами экспертов и ссылками на дополнительные ресурсы. Цель материала — дать читателю инструменты для самостоятельного развития и принятия осознанных решений.
    Практические советы ждут тебя – https://drsourabhsharmakota.com/portfolio/minimally-invasive-cardiac-surgery

    回复

  22. Этот текст призван помочь читателю расширить кругозор и получить практические знания. Мы используем простой язык, наглядные примеры и структурированное изложение, чтобы сделать обучение максимально эффективным и увлекательным.
    Обратитесь за информацией – https://frameteknik.com/markup-html-tags-formatting

    回复

  23. Эта публикация завернет вас в вихрь увлекательного контента, сбрасывая стереотипы и открывая двери к новым идеям. Каждый абзац станет для вас открытием, полным ярких примеров и впечатляющих достижений. Подготовьтесь быть вовлеченными и удивленными каждый раз, когда продолжите читать.
    Расширить кругозор по теме – https://ravtoz.ru

    回复

  24. Эта статья предлагает живое освещение актуальной темы с множеством интересных фактов. Мы рассмотрим ключевые моменты, которые делают данную тему важной и актуальной. Подготовьтесь к насыщенному путешествию по неизвестным аспектам и узнайте больше о значимых событиях.
    Более того — здесь – https://www.henkleeuwerink.nl/hello-world

    回复

  25. Этот увлекательный информационный материал подарит вам массу новых знаний и ярких эмоций. Мы собрали для вас интересные факты и сведения, которые обогатят ваш опыт. Откройте для себя увлекательный мир информации и насладитесь процессом изучения!
    Лучшее решение — прямо здесь – https://eastleighdivingclub.co.uk/introducing-new-styles-of-football-soccer

    回复

  26. Этот информативный текст выделяется своими захватывающими аспектами, которые делают сложные темы доступными и понятными. Мы стремимся предложить читателям глубину знаний вместе с разнообразием интересных фактов. Откройте новые горизонты и развивайте свои способности познавать мир!
    Смотрите также… – https://linuxdaybari.it/chiusura

    回复

  27. Этот информационный обзор станет отличным путеводителем по актуальным темам, объединяющим важные факты и мнения экспертов. Мы исследуем ключевые идеи и представляем их в доступной форме для более глубокого понимания. Читайте, чтобы оставаться в курсе событий!
    Практические советы ждут тебя – https://www.larutadelosvolcanes.com/volcan-cumbal

    回复

  28. Эта статья для ознакомления предлагает читателям общее представление об актуальной теме. Мы стремимся представить ключевые факты и идеи, которые помогут читателям получить представление о предмете и решить, стоит ли углубляться в изучение.
    Ознакомьтесь с аналитикой – http://muziekpromo.net/post/34

    回复

  29. В этой публикации мы предлагаем подробные объяснения по актуальным вопросам, чтобы помочь читателям глубже понять их. Четкость и структурированность материала сделают его удобным для усвоения и применения в повседневной жизни.
    Обратиться к источнику – https://newshaveli.com/tag/shani-shingnapur-village

    回复

  30. Этот интересный отчет представляет собой сборник полезных фактов, касающихся актуальных тем. Мы проанализируем данные, чтобы вы могли сделать обоснованные выводы. Читайте, чтобы узнать больше о последних трендах и значимых событиях!
    Это ещё не всё… – http://www.sobolyfamily.ru

    回复

  31. Этот увлекательный информационный материал подарит вам массу новых знаний и ярких эмоций. Мы собрали для вас интересные факты и сведения, которые обогатят ваш опыт. Откройте для себя увлекательный мир информации и насладитесь процессом изучения!
    Подробнее – https://www.medallasramirez.cl/articulos-de-regalo

    回复

  32. В этой публикации мы предлагаем подробные объяснения по актуальным вопросам, чтобы помочь читателям глубже понять их. Четкость и структурированность материала сделают его удобным для усвоения и применения в повседневной жизни.
    Лучшее решение — прямо здесь – https://www.propertysmart.ie/ufaqs/do-i-know-who-is-providing-the-services

    回复

  33. Эта информационная статья содержит полезные факты, советы и рекомендации, которые помогут вам быть в курсе последних тенденций и изменений в выбранной области. Материал составлен так, чтобы быть полезным и понятным каждому.
    Более того — здесь – https://odontologiaeoc.cl/ortodonciainvisible

    回复

  34. Этот текст призван помочь читателю расширить кругозор и получить практические знания. Мы используем простой язык, наглядные примеры и структурированное изложение, чтобы сделать обучение максимально эффективным и увлекательным.
    Почему это важно? – https://5stardrivingschooledmonton.ca/why-5-star-driving-school-edmonton-is-the-best-choice-for-new-drivers

    回复

  35. Этот текст сочетает в себе элементы познавательного рассказа и аналитической подачи информации. Читатель получает доступ к уникальным данным, которые соединяют прошлое с настоящим и открывают двери в будущее.
    Открыть полностью – https://alexandr-saharov.ru/?paged=18&cat=1

    回复

  36. В этой публикации мы предлагаем подробные объяснения по актуальным вопросам, чтобы помочь читателям глубже понять их. Четкость и структурированность материала сделают его удобным для усвоения и применения в повседневной жизни.
    Узнать напрямую – https://36video.ru/?paged=52

    回复

  37. Этот текст призван помочь читателю расширить кругозор и получить практические знания. Мы используем простой язык, наглядные примеры и структурированное изложение, чтобы сделать обучение максимально эффективным и увлекательным.
    Нажмите, чтобы узнать больше – https://1st-print.ru/?paged=12

    回复

  38. Мы предлагаем вам подробное руководство, основанное на проверенных источниках и реальных примерах. Каждая часть публикации направлена на то, чтобы помочь вам разобраться в сложных вопросах и применить знания на практике.
    Читать дальше – https://enpublico.mx/2023/01/07/descartan-frios-para-el-fin-de-semana

    回复

  39. В этой публикации мы предлагаем подробные объяснения по актуальным вопросам, чтобы помочь читателям глубже понять их. Четкость и структурированность материала сделают его удобным для усвоения и применения в повседневной жизни.
    Смотрите также… – https://tirtacakra.com/stay-informed-and-inspired-popular-non-fiction-ebooks

    回复

  40. Публикация приглашает вас исследовать неизведанное — от древних тайн до современных достижений науки. Вы узнаете, как случайные находки превращались в революции, а смелые мысли — в новые эры человеческого прогресса.
    Секреты успеха внутри – https://f5fashion.vn/fact-check-is-alexia-putellas-a-lesbian-meet-his-girlfriend-olga-rios

    回复

  41. Публикация предлагает уникальную подборку информации, которая будет интересна как специалистам, так и широкому кругу читателей. Здесь вы найдете ответы на часто задаваемые вопросы и полезные инсайты для дальнейшего применения.
    Ознакомьтесь с аналитикой – https://diatech-uae.com/tongue-depressor

    回复

  42. В данной обзорной статье представлены интригующие факты, которые не оставят вас равнодушными. Мы критикуем и анализируем события, которые изменили наше восприятие мира. Узнайте, что стоит за новыми открытиями и как они могут изменить ваше восприятие реальности.
    Получить дополнительную информацию – https://thpt.thayhien.com/de-thi-thu-tot-nghiep-thpt-2023-mon-toan-lan-1-ba-ria-vung-tau

    回复

  43. Этот обзорный материал предоставляет информационно насыщенные данные, касающиеся актуальных тем. Мы стремимся сделать информацию доступной и структурированной, чтобы читатели могли легко ориентироваться в наших выводах. Познайте новое с нашим обзором!
    Исследовать вопрос подробнее – https://vistoweekly.com/american-musican-and-dramatic-academy-ash-straw

    回复

  44. В этой публикации мы сосредоточимся на интересных аспектах одной из самых актуальных тем современности. Совмещая факты и мнения экспертов, мы создадим полное представление о предмете, которое будет полезно как новичкам, так и тем, кто глубоко изучает вопрос.
    Подробнее – https://vyvod-iz-zapoya-1.ru/

    回复

  45. Этот информационный материал привлекает внимание множеством интересных деталей и необычных ракурсов. Мы предлагаем уникальные взгляды на привычные вещи и рассматриваем вопросы, которые волнуют общество. Будьте в курсе актуальных тем и расширяйте свои знания!
    Ознакомиться с деталями – https://vyvod-iz-zapoya-1.ru/

    回复

  48. WOW just what I was looking for. Came here by searching for keyword. Thanx to creators of this board.

    回复

  50. Thank you for all of the labor on this blog. My mum loves participating in investigation and it’s obvious why. Almost all hear all concerning the lively means you convey precious guides by means of this web site and as well as improve contribution from other ones on this area of interest and our simple princess is in fact becoming educated a lot of things. Enjoy the rest of the new year. You’re conducting a tremendous job.

    回复

  52. Asking questions are in fact good thing if you are not understanding something entirely, however this article presents pleasant understanding yet.

    回复

  54. This is tremendous. Hmm, it seems like your site ate my first comment (it was extremely long) so I guess I’ll just sum it up what I had written and say, I’m thoroughly enjoying your blog. I as well am an aspiring blog writer, but I’m still new to the whole thing. Do you have any recommendations for newbie blog writers? I’d appreciate it.

    asapmebajoaragon.org

    回复

  58. “You have not fucked, have you, my son? Have you?” His father asks, as he readjusts the cock covered and swelling in his khaki pants. “I thought as much.”

    回复

  59. “Have you fucked, son? Have you fucked? Have you dumped that seed of yours in those balls into a moist hole?” His father asks as he leans forward on the commode-chair. His hand squeezing the bulge growing larger in his tan khakis.

    回复

  62. “FUCK! FUCK!” He says, as he loosens the tightened grip on his fleshy-red-tool, while it throbs with its life-giving blood coursing through its many vein-filled region. Daddy was furious as I could hear his deep breath. He sat down on the bench by the door. I was looking down afraid he was going to kick my ass. He lifted my head from my chin using the tip of his loafer where I can smell that smelly sheer socks he has been worn all day. Just when our eyes met, a big stinky manly wad landed on my face. Then I felt a big rough hand rubbing the spit all over my face. I heard the daddy say, “ next time remember what I told you exactly, I don’t want this to happen again, you hear me? I paused and said, “ yeeee…”. Before I finished the sentence, another spit and a big slap on me. “ when I told you something you must say yes. There is no room for you to argue or think, understood?” He said in a deep and firm tone. “ yes sir”. Without missing a beep I said it. “good boy, your night is just about to start.”

    回复

  63. I didn’t move and I didn’t want to move because the smell in there is so toxic. I can smell daddy’s unwashed ass in there. I was also so happy as daddy sat on the toilet to released his scent just for me to sniff. Just when The scent faded away I heard the daddy say, “Come here, boy.” I saw daddy sitting on my couch with nothing but a white brief on. The bulge was staring at me. I knew I was going to be having a wonderful night. “I figured you did.” His father says. “You play on a team, so you know the purpose of teamwork.”

    回复
联系我们

联系我们

(44)07934433023

在线咨询: QQ交谈

邮箱: info@bioengx.org

关注微信
微信扫一扫关注我们

微信扫一扫关注我们

关注微博
返回顶部